La museografía de las exposiciones temporales se desarrolla fundamentalmente en los espacios que conforma la Capilla ochavada del Palacio de Carlos V, distribuidas en dos plantas superpuestas: la Capilla, la Cripta y las salas complementarias, entre las que se incluye la Sala de Presentación del Monumento, lugar dotado expresamente, entre otros, para la difusión (vitrinas integradas, diaporama-audiovisual, mostrador-expositor, maquetas, etc.).