El Área de Conservación se divide en 6 grandes programas. Por un lado, el programa de Conservación que no sólo se centra en el Conjunto Monumental, sino que tiene como una de sus prioridades la protección y gestión sostenible de los recursos patrimoniales y paisajísticos de la Alhambra. El programa de Restauración desarrolla sus intervenciones con una estrategia de conservación preventiva y ejecutiva. Por su parte, en el programa de Arqueología se desarrolla una importante labor investigadora que ha dado notables frutos en los últimos años. Finalmente la protección, ordenación y gestión sostenible del paisaje y la conservación de los ecosistemas y hábitats naturales corre a cargo de los programas de Bosques, Jardines y Huertas y del Programa de Biodiversidad.